Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms