Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5F1P24539 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5F1P24539 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms