Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRGP23470 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms