Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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