Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MYF6P23409 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MYF6P23409 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MYF6P23409 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MYF6P23409 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MYF6P23409 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MYF6P23409 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MYF6P23409 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MYF6P23409 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MYF6P23409 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MYF6P23409 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MYF6P23409 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MYF6P23409 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MYF6P23409 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MYF6P23409 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MYF6P23409 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MYF6P23409 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MYF6P23409 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MYF6P23409 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYF6P23409 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYF6P23409 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYF6P23409 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYF6P23409 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYF6P23409 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYF6P23409 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYF6P23409 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYF6P23409 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYF6P23409 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYF6P23409 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYF6P23409 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYF6P23409 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MYF6P23409 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYF6P23409 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYF6P23409 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYF6P23409 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYF6P23409 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYF6P23409 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYF6P23409 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYF6P23409 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYF6P23409 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYF6P23409 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MYF6P23409 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYF6P23409 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MYF6P23409 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYF6P23409 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYF6P23409 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYF6P23409 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYF6P23409 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYF6P23409 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYF6P23409 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYF6P23409 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYF6P23409 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYF6P23409 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYF6P23409 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYF6P23409 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MYF6P23409 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYF6P23409 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYF6P23409 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYF6P23409 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYF6P23409 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYF6P23409 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MYF6P23409 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYF6P23409 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYF6P23409 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYF6P23409 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYF6P23409 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MYF6P23409 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYF6P23409 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYF6P23409 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYF6P23409 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYF6P23409 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYF6P23409 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYF6P23409 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYF6P23409 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYF6P23409 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYF6P23409 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYF6P23409 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYF6P23409 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYF6P23409 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYF6P23409 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYF6P23409 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYF6P23409 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYF6P23409 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYF6P23409 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYF6P23409 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYF6P23409 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYF6P23409 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYF6P23409 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYF6P23409 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYF6P23409 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYF6P23409 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYF6P23409 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYF6P23409 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYF6P23409 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYF6P23409 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYF6P23409 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYF6P23409 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYF6P23409 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYF6P23409 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYF6P23409 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms