Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms