Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN2P17655 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms