Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF7P17544 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF7P17544 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF7P17544 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF7P17544 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF7P17544 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF7P17544 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF7P17544 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF7P17544 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF7P17544 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF7P17544 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF7P17544 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF7P17544 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF7P17544 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF7P17544 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF7P17544 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF7P17544 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF7P17544 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF7P17544 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF7P17544 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF7P17544 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF7P17544 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF7P17544 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF7P17544 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF7P17544 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF7P17544 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF7P17544 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF7P17544 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF7P17544 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF7P17544 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF7P17544 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF7P17544 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF7P17544 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF7P17544 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF7P17544 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF7P17544 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF7P17544 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF7P17544 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF7P17544 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF7P17544 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF7P17544 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF7P17544 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF7P17544 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF7P17544 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF7P17544 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF7P17544 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF7P17544 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF7P17544 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF7P17544 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF7P17544 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF7P17544 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF7P17544 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF7P17544 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF7P17544 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF7P17544 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF7P17544 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF7P17544 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF7P17544 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF7P17544 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF7P17544 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF7P17544 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF7P17544 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF7P17544 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF7P17544 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF7P17544 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF7P17544 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF7P17544 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF7P17544 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF7P17544 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF7P17544 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF7P17544 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF7P17544 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF7P17544 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF7P17544 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF7P17544 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF7P17544 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF7P17544 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF7P17544 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF7P17544 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF7P17544 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF7P17544 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF7P17544 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF7P17544 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF7P17544 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF7P17544 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF7P17544 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF7P17544 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF7P17544 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF7P17544 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF7P17544 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATF7P17544 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATF7P17544 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATF7P17544 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATF7P17544 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATF7P17544 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATF7P17544 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATF7P17544 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATF7P17544 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATF7P17544 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATF7P17544 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms