Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB3P16520 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB3P16520 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB3P16520 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB3P16520 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB3P16520 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB3P16520 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB3P16520 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB3P16520 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB3P16520 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNB3P16520 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB3P16520 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB3P16520 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB3P16520 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB3P16520 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB3P16520 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB3P16520 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB3P16520 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB3P16520 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB3P16520 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB3P16520 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB3P16520 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB3P16520 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB3P16520 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB3P16520 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB3P16520 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB3P16520 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB3P16520 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB3P16520 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB3P16520 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB3P16520 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB3P16520 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB3P16520 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB3P16520 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms