Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD44P16070 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CD44P16070 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD44P16070 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD44P16070 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD44P16070 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD44P16070 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD44P16070 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD44P16070 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD44P16070 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD44P16070 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD44P16070 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD44P16070 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD44P16070 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD44P16070 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD44P16070 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD44P16070 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CD44P16070 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD44P16070 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD44P16070 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD44P16070 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD44P16070 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD44P16070 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD44P16070 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD44P16070 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD44P16070 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD44P16070 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD44P16070 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CD44P16070 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD44P16070 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD44P16070 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD44P16070 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD44P16070 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD44P16070 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD44P16070 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CD44P16070 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD44P16070 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD44P16070 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD44P16070 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD44P16070 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD44P16070 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD44P16070 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD44P16070 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD44P16070 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD44P16070 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD44P16070 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD44P16070 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD44P16070 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD44P16070 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CD44P16070 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD44P16070 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD44P16070 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD44P16070 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD44P16070 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD44P16070 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD44P16070 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD44P16070 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD44P16070 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD44P16070 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD44P16070 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD44P16070 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD44P16070 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD44P16070 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD44P16070 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD44P16070 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD44P16070 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD44P16070 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD44P16070 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD44P16070 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD44P16070 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD44P16070 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD44P16070 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD44P16070 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD44P16070 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD44P16070 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD44P16070 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD44P16070 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD44P16070 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD44P16070 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD44P16070 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD44P16070 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD44P16070 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD44P16070 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD44P16070 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CD44P16070 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD44P16070 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD44P16070 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD44P16070 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CD44P16070 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD44P16070 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD44P16070 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD44P16070 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CD44P16070 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD44P16070 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CD44P16070 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD44P16070 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD44P16070 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD44P16070 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CD44P16070 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CD44P16070 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms