Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSPP15924 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSPP15924 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSPP15924 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSPP15924 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSPP15924 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSPP15924 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSPP15924 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSPP15924 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSPP15924 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSPP15924 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSPP15924 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSPP15924 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DSPP15924 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DSPP15924 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DSPP15924 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DSPP15924 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DSPP15924 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DSPP15924 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
DSPP15924 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
DSPP15924 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DSPP15924 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DSPP15924 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DSPP15924 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DSPP15924 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DSPP15924 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DSPP15924 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DSPP15924 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DSPP15924 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DSPP15924 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DSPP15924 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DSPP15924 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DSPP15924 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DSPP15924 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DSPP15924 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DSPP15924 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DSPP15924 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSPP15924 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSPP15924 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSPP15924 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSPP15924 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSPP15924 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSPP15924 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DSPP15924 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSPP15924 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSPP15924 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSPP15924 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DSPP15924 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSPP15924 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSPP15924 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSPP15924 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSPP15924 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSPP15924 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSPP15924 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSPP15924 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSPP15924 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSPP15924 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSPP15924 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSPP15924 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSPP15924 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSPP15924 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSPP15924 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSPP15924 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSPP15924 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSPP15924 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSPP15924 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSPP15924 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSPP15924 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSPP15924 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSPP15924 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSPP15924 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSPP15924 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSPP15924 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSPP15924 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSPP15924 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSPP15924 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DSPP15924 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSPP15924 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSPP15924 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSPP15924 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSPP15924 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSPP15924 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSPP15924 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSPP15924 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DSPP15924 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DSPP15924 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSPP15924 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSPP15924 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSPP15924 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSPP15924 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSPP15924 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSPP15924 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSPP15924 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSPP15924 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSPP15924 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSPP15924 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSPP15924 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSPP15924 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSPP15924 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSPP15924 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms