Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms