Protein–RNA interactions for Protein: P0CF51

TRGC1, T-cell receptor gamma chain C region 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRGC1P0CF51 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRGC1P0CF51 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRGC1P0CF51 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRGC1P0CF51 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRGC1P0CF51 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRGC1P0CF51 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRGC1P0CF51 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRGC1P0CF51 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRGC1P0CF51 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRGC1P0CF51 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRGC1P0CF51 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRGC1P0CF51 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRGC1P0CF51 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRGC1P0CF51 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRGC1P0CF51 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRGC1P0CF51 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRGC1P0CF51 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms