Protein–RNA interactions for Protein: P09341

CXCL1, Growth-regulated alpha protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL1P09341 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms