Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NGFRP08138 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NGFRP08138 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NGFRP08138 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NGFRP08138 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NGFRP08138 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NGFRP08138 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NGFRP08138 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NGFRP08138 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NGFRP08138 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NGFRP08138 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NGFRP08138 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NGFRP08138 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NGFRP08138 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NGFRP08138 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NGFRP08138 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NGFRP08138 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NGFRP08138 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NGFRP08138 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NGFRP08138 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NGFRP08138 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NGFRP08138 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NGFRP08138 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NGFRP08138 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NGFRP08138 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NGFRP08138 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NGFRP08138 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NGFRP08138 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NGFRP08138 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NGFRP08138 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NGFRP08138 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NGFRP08138 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NGFRP08138 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NGFRP08138 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NGFRP08138 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NGFRP08138 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NGFRP08138 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NGFRP08138 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NGFRP08138 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NGFRP08138 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NGFRP08138 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NGFRP08138 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NGFRP08138 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NGFRP08138 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NGFRP08138 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NGFRP08138 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NGFRP08138 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NGFRP08138 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NGFRP08138 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NGFRP08138 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NGFRP08138 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NGFRP08138 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NGFRP08138 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NGFRP08138 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NGFRP08138 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NGFRP08138 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NGFRP08138 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NGFRP08138 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NGFRP08138 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NGFRP08138 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NGFRP08138 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NGFRP08138 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NGFRP08138 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NGFRP08138 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NGFRP08138 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NGFRP08138 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NGFRP08138 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NGFRP08138 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NGFRP08138 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NGFRP08138 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NGFRP08138 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NGFRP08138 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NGFRP08138 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NGFRP08138 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NGFRP08138 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NGFRP08138 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NGFRP08138 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NGFRP08138 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NGFRP08138 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NGFRP08138 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NGFRP08138 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NGFRP08138 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NGFRP08138 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NGFRP08138 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NGFRP08138 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NGFRP08138 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NGFRP08138 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NGFRP08138 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NGFRP08138 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NGFRP08138 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NGFRP08138 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NGFRP08138 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NGFRP08138 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NGFRP08138 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NGFRP08138 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NGFRP08138 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NGFRP08138 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NGFRP08138 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NGFRP08138 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NGFRP08138 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms