Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFNB1P01574 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNB1P01574 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms