Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX58O95786 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX58O95786 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX58O95786 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX58O95786 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX58O95786 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX58O95786 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX58O95786 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX58O95786 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX58O95786 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX58O95786 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX58O95786 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX58O95786 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX58O95786 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX58O95786 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX58O95786 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX58O95786 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX58O95786 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX58O95786 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX58O95786 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX58O95786 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX58O95786 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX58O95786 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX58O95786 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX58O95786 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX58O95786 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX58O95786 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX58O95786 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX58O95786 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX58O95786 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX58O95786 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX58O95786 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX58O95786 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX58O95786 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX58O95786 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX58O95786 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX58O95786 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX58O95786 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX58O95786 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX58O95786 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX58O95786 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX58O95786 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX58O95786 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX58O95786 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX58O95786 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX58O95786 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX58O95786 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX58O95786 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX58O95786 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX58O95786 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX58O95786 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX58O95786 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX58O95786 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX58O95786 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX58O95786 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX58O95786 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX58O95786 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX58O95786 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX58O95786 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX58O95786 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX58O95786 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX58O95786 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX58O95786 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX58O95786 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX58O95786 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX58O95786 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX58O95786 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX58O95786 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX58O95786 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX58O95786 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX58O95786 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX58O95786 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX58O95786 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX58O95786 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX58O95786 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX58O95786 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX58O95786 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX58O95786 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX58O95786 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX58O95786 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX58O95786 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX58O95786 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX58O95786 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX58O95786 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX58O95786 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX58O95786 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX58O95786 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX58O95786 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX58O95786 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX58O95786 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX58O95786 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX58O95786 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX58O95786 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX58O95786 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX58O95786 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX58O95786 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX58O95786 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX58O95786 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX58O95786 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX58O95786 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms