Protein–RNA interactions for Protein: O95395

GCNT3, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT3O95395 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT3O95395 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT3O95395 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT3O95395 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT3O95395 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT3O95395 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT3O95395 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT3O95395 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT3O95395 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT3O95395 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNT3O95395 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms