Protein–RNA interactions for Protein: O75663

TIPRL, TIP41-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIPRLO75663 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIPRLO75663 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIPRLO75663 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms