Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC45O75419 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC45O75419 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC45O75419 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC45O75419 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC45O75419 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC45O75419 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC45O75419 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC45O75419 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC45O75419 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC45O75419 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC45O75419 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC45O75419 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC45O75419 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC45O75419 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC45O75419 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC45O75419 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC45O75419 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC45O75419 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC45O75419 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC45O75419 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC45O75419 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC45O75419 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC45O75419 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC45O75419 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC45O75419 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC45O75419 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC45O75419 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC45O75419 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC45O75419 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC45O75419 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC45O75419 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC45O75419 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC45O75419 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC45O75419 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC45O75419 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC45O75419 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC45O75419 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC45O75419 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC45O75419 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC45O75419 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC45O75419 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC45O75419 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC45O75419 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC45O75419 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC45O75419 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC45O75419 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC45O75419 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC45O75419 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC45O75419 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC45O75419 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC45O75419 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC45O75419 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC45O75419 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC45O75419 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC45O75419 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC45O75419 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC45O75419 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC45O75419 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC45O75419 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC45O75419 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC45O75419 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC45O75419 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC45O75419 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC45O75419 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC45O75419 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC45O75419 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC45O75419 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC45O75419 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDC45O75419 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDC45O75419 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDC45O75419 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC45O75419 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC45O75419 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC45O75419 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC45O75419 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC45O75419 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC45O75419 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC45O75419 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC45O75419 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC45O75419 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC45O75419 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC45O75419 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC45O75419 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC45O75419 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC45O75419 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC45O75419 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC45O75419 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC45O75419 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC45O75419 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC45O75419 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC45O75419 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC45O75419 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC45O75419 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC45O75419 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC45O75419 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC45O75419 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC45O75419 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC45O75419 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC45O75419 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms