Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCRIPO60506 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNCRIPO60506 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNCRIPO60506 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNCRIPO60506 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms