Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC31.64■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms