Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HTATSF1O43719 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms