Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATCO43716 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATCO43716 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATCO43716 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATCO43716 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GATCO43716 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATCO43716 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATCO43716 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATCO43716 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATCO43716 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATCO43716 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATCO43716 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATCO43716 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATCO43716 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATCO43716 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATCO43716 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATCO43716 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATCO43716 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATCO43716 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATCO43716 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATCO43716 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATCO43716 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATCO43716 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATCO43716 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATCO43716 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATCO43716 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATCO43716 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATCO43716 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATCO43716 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATCO43716 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATCO43716 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATCO43716 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATCO43716 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATCO43716 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATCO43716 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATCO43716 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATCO43716 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATCO43716 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATCO43716 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATCO43716 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATCO43716 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATCO43716 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GATCO43716 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATCO43716 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATCO43716 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATCO43716 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATCO43716 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATCO43716 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATCO43716 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATCO43716 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATCO43716 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATCO43716 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GATCO43716 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATCO43716 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATCO43716 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATCO43716 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATCO43716 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATCO43716 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATCO43716 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATCO43716 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATCO43716 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATCO43716 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATCO43716 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATCO43716 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GATCO43716 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATCO43716 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATCO43716 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATCO43716 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATCO43716 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATCO43716 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATCO43716 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATCO43716 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATCO43716 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATCO43716 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GATCO43716 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATCO43716 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATCO43716 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATCO43716 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATCO43716 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATCO43716 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATCO43716 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATCO43716 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATCO43716 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATCO43716 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATCO43716 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATCO43716 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GATCO43716 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GATCO43716 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GATCO43716 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATCO43716 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATCO43716 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATCO43716 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATCO43716 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATCO43716 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATCO43716 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATCO43716 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATCO43716 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATCO43716 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATCO43716 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATCO43716 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms