Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms