Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTIFO43310 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTIFO43310 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTIFO43310 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTIFO43310 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTIFO43310 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTIFO43310 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTIFO43310 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CTIFO43310 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTIFO43310 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTIFO43310 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTIFO43310 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTIFO43310 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTIFO43310 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTIFO43310 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTIFO43310 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTIFO43310 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTIFO43310 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTIFO43310 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTIFO43310 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CTIFO43310 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTIFO43310 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTIFO43310 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTIFO43310 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTIFO43310 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTIFO43310 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTIFO43310 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTIFO43310 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CTIFO43310 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTIFO43310 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTIFO43310 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTIFO43310 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTIFO43310 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTIFO43310 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTIFO43310 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTIFO43310 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTIFO43310 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTIFO43310 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTIFO43310 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTIFO43310 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTIFO43310 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTIFO43310 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTIFO43310 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTIFO43310 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTIFO43310 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTIFO43310 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTIFO43310 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTIFO43310 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTIFO43310 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTIFO43310 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTIFO43310 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTIFO43310 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTIFO43310 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTIFO43310 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTIFO43310 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTIFO43310 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTIFO43310 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTIFO43310 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTIFO43310 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTIFO43310 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTIFO43310 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTIFO43310 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTIFO43310 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTIFO43310 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTIFO43310 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTIFO43310 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTIFO43310 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTIFO43310 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTIFO43310 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTIFO43310 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTIFO43310 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTIFO43310 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTIFO43310 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CTIFO43310 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTIFO43310 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CTIFO43310 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTIFO43310 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTIFO43310 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTIFO43310 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTIFO43310 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTIFO43310 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTIFO43310 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTIFO43310 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTIFO43310 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTIFO43310 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CTIFO43310 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTIFO43310 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CTIFO43310 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTIFO43310 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTIFO43310 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTIFO43310 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTIFO43310 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTIFO43310 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTIFO43310 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTIFO43310 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTIFO43310 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTIFO43310 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTIFO43310 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTIFO43310 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTIFO43310 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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