Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms