Protein–RNA interactions for Protein: O14965

AURKA, Aurora kinase A, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AURKAO14965 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AURKAO14965 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AURKAO14965 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AURKAO14965 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AURKAO14965 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AURKAO14965 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AURKAO14965 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AURKAO14965 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AURKAO14965 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AURKAO14965 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AURKAO14965 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AURKAO14965 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AURKAO14965 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AURKAO14965 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
AURKAO14965 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AURKAO14965 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AURKAO14965 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AURKAO14965 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AURKAO14965 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AURKAO14965 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AURKAO14965 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AURKAO14965 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AURKAO14965 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AURKAO14965 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AURKAO14965 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AURKAO14965 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AURKAO14965 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AURKAO14965 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AURKAO14965 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AURKAO14965 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AURKAO14965 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
AURKAO14965 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AURKAO14965 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AURKAO14965 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AURKAO14965 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AURKAO14965 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AURKAO14965 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AURKAO14965 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AURKAO14965 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AURKAO14965 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AURKAO14965 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AURKAO14965 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AURKAO14965 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AURKAO14965 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AURKAO14965 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AURKAO14965 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AURKAO14965 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AURKAO14965 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AURKAO14965 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AURKAO14965 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AURKAO14965 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AURKAO14965 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AURKAO14965 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AURKAO14965 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AURKAO14965 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AURKAO14965 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AURKAO14965 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AURKAO14965 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AURKAO14965 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
AURKAO14965 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AURKAO14965 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AURKAO14965 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AURKAO14965 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AURKAO14965 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AURKAO14965 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AURKAO14965 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AURKAO14965 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AURKAO14965 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
AURKAO14965 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AURKAO14965 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AURKAO14965 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AURKAO14965 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AURKAO14965 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AURKAO14965 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AURKAO14965 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
AURKAO14965 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AURKAO14965 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AURKAO14965 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AURKAO14965 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
AURKAO14965 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AURKAO14965 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AURKAO14965 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AURKAO14965 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AURKAO14965 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AURKAO14965 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AURKAO14965 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AURKAO14965 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
AURKAO14965 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AURKAO14965 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AURKAO14965 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AURKAO14965 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AURKAO14965 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AURKAO14965 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
AURKAO14965 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AURKAO14965 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AURKAO14965 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AURKAO14965 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AURKAO14965 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AURKAO14965 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AURKAO14965 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms