Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
POLR3AO14802 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR3AO14802 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms