Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DFFAO00273 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DFFAO00273 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DFFAO00273 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DFFAO00273 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DFFAO00273 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DFFAO00273 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DFFAO00273 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DFFAO00273 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DFFAO00273 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DFFAO00273 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DFFAO00273 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DFFAO00273 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DFFAO00273 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DFFAO00273 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DFFAO00273 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DFFAO00273 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DFFAO00273 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DFFAO00273 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DFFAO00273 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DFFAO00273 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DFFAO00273 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DFFAO00273 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DFFAO00273 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DFFAO00273 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DFFAO00273 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DFFAO00273 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DFFAO00273 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DFFAO00273 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DFFAO00273 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DFFAO00273 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DFFAO00273 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DFFAO00273 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DFFAO00273 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DFFAO00273 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DFFAO00273 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DFFAO00273 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DFFAO00273 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DFFAO00273 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DFFAO00273 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DFFAO00273 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DFFAO00273 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DFFAO00273 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DFFAO00273 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DFFAO00273 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DFFAO00273 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DFFAO00273 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DFFAO00273 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DFFAO00273 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DFFAO00273 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DFFAO00273 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DFFAO00273 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DFFAO00273 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DFFAO00273 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DFFAO00273 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DFFAO00273 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DFFAO00273 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DFFAO00273 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DFFAO00273 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DFFAO00273 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DFFAO00273 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DFFAO00273 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DFFAO00273 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DFFAO00273 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DFFAO00273 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DFFAO00273 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DFFAO00273 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DFFAO00273 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DFFAO00273 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DFFAO00273 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DFFAO00273 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DFFAO00273 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DFFAO00273 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DFFAO00273 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DFFAO00273 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DFFAO00273 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DFFAO00273 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DFFAO00273 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DFFAO00273 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DFFAO00273 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DFFAO00273 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DFFAO00273 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DFFAO00273 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DFFAO00273 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DFFAO00273 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DFFAO00273 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DFFAO00273 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DFFAO00273 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DFFAO00273 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DFFAO00273 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DFFAO00273 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DFFAO00273 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DFFAO00273 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DFFAO00273 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DFFAO00273 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DFFAO00273 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DFFAO00273 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DFFAO00273 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DFFAO00273 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DFFAO00273 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms