Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BECN2A8MW95 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN2A8MW95 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms