Protein–RNA interactions for Protein: A8K8P3

SFI1, Protein SFI1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFI1A8K8P3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFI1A8K8P3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFI1A8K8P3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms