Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC9

SH2D7, SH2 domain-containing protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D7A6NKC9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms