Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms