Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms