Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH30

IGHV3-16, Immunoglobulin heavy variable 3-16 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-16A0A0C4DH30 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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IGHV3-16A0A0C4DH30 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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IGHV3-16A0A0C4DH30 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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IGHV3-16A0A0C4DH30 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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IGHV3-16A0A0C4DH30 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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IGHV3-16A0A0C4DH30 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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IGHV3-16A0A0C4DH30 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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IGHV3-16A0A0C4DH30 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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IGHV3-16A0A0C4DH30 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IGHV3-16A0A0C4DH30 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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