Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CD2APQ9Y5K6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CD2APQ9Y5K6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CD2APQ9Y5K6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CD2APQ9Y5K6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CD2APQ9Y5K6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CD2APQ9Y5K6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CD2APQ9Y5K6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CD2APQ9Y5K6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CD2APQ9Y5K6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
CD2APQ9Y5K6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CD2APQ9Y5K6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CD2APQ9Y5K6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CD2APQ9Y5K6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CD2APQ9Y5K6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CD2APQ9Y5K6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CD2APQ9Y5K6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CD2APQ9Y5K6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CD2APQ9Y5K6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CD2APQ9Y5K6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CD2APQ9Y5K6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CD2APQ9Y5K6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CD2APQ9Y5K6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CD2APQ9Y5K6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CD2APQ9Y5K6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
CD2APQ9Y5K6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CD2APQ9Y5K6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CD2APQ9Y5K6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CD2APQ9Y5K6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CD2APQ9Y5K6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
CD2APQ9Y5K6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CD2APQ9Y5K6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
CD2APQ9Y5K6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CD2APQ9Y5K6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CD2APQ9Y5K6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CD2APQ9Y5K6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CD2APQ9Y5K6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
CD2APQ9Y5K6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CD2APQ9Y5K6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CD2APQ9Y5K6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CD2APQ9Y5K6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CD2APQ9Y5K6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
CD2APQ9Y5K6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CD2APQ9Y5K6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CD2APQ9Y5K6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CD2APQ9Y5K6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CD2APQ9Y5K6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CD2APQ9Y5K6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CD2APQ9Y5K6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
CD2APQ9Y5K6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CD2APQ9Y5K6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CD2APQ9Y5K6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CD2APQ9Y5K6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CD2APQ9Y5K6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CD2APQ9Y5K6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CD2APQ9Y5K6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CD2APQ9Y5K6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CD2APQ9Y5K6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CD2APQ9Y5K6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CD2APQ9Y5K6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CD2APQ9Y5K6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CD2APQ9Y5K6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CD2APQ9Y5K6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CD2APQ9Y5K6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CD2APQ9Y5K6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CD2APQ9Y5K6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CD2APQ9Y5K6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CD2APQ9Y5K6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CD2APQ9Y5K6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CD2APQ9Y5K6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
CD2APQ9Y5K6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CD2APQ9Y5K6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CD2APQ9Y5K6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CD2APQ9Y5K6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CD2APQ9Y5K6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CD2APQ9Y5K6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CD2APQ9Y5K6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CD2APQ9Y5K6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
CD2APQ9Y5K6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CD2APQ9Y5K6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CD2APQ9Y5K6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CD2APQ9Y5K6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CD2APQ9Y5K6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
CD2APQ9Y5K6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CD2APQ9Y5K6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CD2APQ9Y5K6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CD2APQ9Y5K6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CD2APQ9Y5K6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CD2APQ9Y5K6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CD2APQ9Y5K6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
CD2APQ9Y5K6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CD2APQ9Y5K6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CD2APQ9Y5K6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CD2APQ9Y5K6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CD2APQ9Y5K6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CD2APQ9Y5K6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CD2APQ9Y5K6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CD2APQ9Y5K6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CD2APQ9Y5K6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CD2APQ9Y5K6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms