Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4R7

TTLL3, Tubulin monoglycylase TTLL3, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3Q9Y4R7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTLL3Q9Y4R7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTLL3Q9Y4R7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTLL3Q9Y4R7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTLL3Q9Y4R7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTLL3Q9Y4R7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL3Q9Y4R7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL3Q9Y4R7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL3Q9Y4R7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL3Q9Y4R7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL3Q9Y4R7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL3Q9Y4R7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL3Q9Y4R7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL3Q9Y4R7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTLL3Q9Y4R7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTLL3Q9Y4R7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTLL3Q9Y4R7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTLL3Q9Y4R7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL3Q9Y4R7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL3Q9Y4R7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL3Q9Y4R7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTLL3Q9Y4R7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTLL3Q9Y4R7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTLL3Q9Y4R7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTLL3Q9Y4R7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTLL3Q9Y4R7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL3Q9Y4R7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL3Q9Y4R7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL3Q9Y4R7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTLL3Q9Y4R7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TTLL3Q9Y4R7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL3Q9Y4R7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL3Q9Y4R7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL3Q9Y4R7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTLL3Q9Y4R7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTLL3Q9Y4R7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTLL3Q9Y4R7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TTLL3Q9Y4R7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTLL3Q9Y4R7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTLL3Q9Y4R7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTLL3Q9Y4R7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTLL3Q9Y4R7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TTLL3Q9Y4R7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTLL3Q9Y4R7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTLL3Q9Y4R7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTLL3Q9Y4R7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTLL3Q9Y4R7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTLL3Q9Y4R7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTLL3Q9Y4R7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTLL3Q9Y4R7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTLL3Q9Y4R7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTLL3Q9Y4R7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TTLL3Q9Y4R7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTLL3Q9Y4R7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTLL3Q9Y4R7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTLL3Q9Y4R7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTLL3Q9Y4R7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTLL3Q9Y4R7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTLL3Q9Y4R7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTLL3Q9Y4R7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTLL3Q9Y4R7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTLL3Q9Y4R7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTLL3Q9Y4R7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTLL3Q9Y4R7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTLL3Q9Y4R7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTLL3Q9Y4R7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms