Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH3BP1Q9Y3L3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH3BP1Q9Y3L3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SH3BP1Q9Y3L3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SH3BP1Q9Y3L3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SH3BP1Q9Y3L3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SH3BP1Q9Y3L3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SH3BP1Q9Y3L3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH3BP1Q9Y3L3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH3BP1Q9Y3L3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH3BP1Q9Y3L3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH3BP1Q9Y3L3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH3BP1Q9Y3L3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH3BP1Q9Y3L3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH3BP1Q9Y3L3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH3BP1Q9Y3L3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH3BP1Q9Y3L3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH3BP1Q9Y3L3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SH3BP1Q9Y3L3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SH3BP1Q9Y3L3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH3BP1Q9Y3L3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH3BP1Q9Y3L3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SH3BP1Q9Y3L3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3BP1Q9Y3L3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3BP1Q9Y3L3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3BP1Q9Y3L3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH3BP1Q9Y3L3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH3BP1Q9Y3L3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH3BP1Q9Y3L3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH3BP1Q9Y3L3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH3BP1Q9Y3L3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3BP1Q9Y3L3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3BP1Q9Y3L3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3BP1Q9Y3L3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3BP1Q9Y3L3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3BP1Q9Y3L3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3BP1Q9Y3L3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3BP1Q9Y3L3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3BP1Q9Y3L3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3BP1Q9Y3L3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3BP1Q9Y3L3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3BP1Q9Y3L3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3BP1Q9Y3L3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3BP1Q9Y3L3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3BP1Q9Y3L3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3BP1Q9Y3L3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3BP1Q9Y3L3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3BP1Q9Y3L3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3BP1Q9Y3L3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3BP1Q9Y3L3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3BP1Q9Y3L3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3BP1Q9Y3L3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3BP1Q9Y3L3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3BP1Q9Y3L3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3BP1Q9Y3L3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3BP1Q9Y3L3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3BP1Q9Y3L3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms