Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TNNQ9UQP3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TNNQ9UQP3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TNNQ9UQP3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TNNQ9UQP3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TNNQ9UQP3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
TNNQ9UQP3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TNNQ9UQP3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TNNQ9UQP3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TNNQ9UQP3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TNNQ9UQP3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TNNQ9UQP3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNNQ9UQP3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNNQ9UQP3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
TNNQ9UQP3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TNNQ9UQP3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TNNQ9UQP3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TNNQ9UQP3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TNNQ9UQP3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
TNNQ9UQP3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TNNQ9UQP3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TNNQ9UQP3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
TNNQ9UQP3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TNNQ9UQP3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TNNQ9UQP3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TNNQ9UQP3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TNNQ9UQP3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TNNQ9UQP3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TNNQ9UQP3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TNNQ9UQP3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TNNQ9UQP3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TNNQ9UQP3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TNNQ9UQP3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TNNQ9UQP3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TNNQ9UQP3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TNNQ9UQP3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
TNNQ9UQP3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNNQ9UQP3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TNNQ9UQP3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TNNQ9UQP3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TNNQ9UQP3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TNNQ9UQP3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TNNQ9UQP3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TNNQ9UQP3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TNNQ9UQP3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TNNQ9UQP3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TNNQ9UQP3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TNNQ9UQP3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TNNQ9UQP3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TNNQ9UQP3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TNNQ9UQP3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TNNQ9UQP3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
TNNQ9UQP3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
TNNQ9UQP3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TNNQ9UQP3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TNNQ9UQP3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
TNNQ9UQP3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TNNQ9UQP3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TNNQ9UQP3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TNNQ9UQP3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
TNNQ9UQP3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TNNQ9UQP3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TNNQ9UQP3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
TNNQ9UQP3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TNNQ9UQP3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TNNQ9UQP3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TNNQ9UQP3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TNNQ9UQP3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TNNQ9UQP3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TNNQ9UQP3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TNNQ9UQP3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNNQ9UQP3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNNQ9UQP3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNNQ9UQP3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TNNQ9UQP3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TNNQ9UQP3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TNNQ9UQP3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TNNQ9UQP3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TNNQ9UQP3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TNNQ9UQP3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TNNQ9UQP3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TNNQ9UQP3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TNNQ9UQP3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TNNQ9UQP3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TNNQ9UQP3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TNNQ9UQP3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
TNNQ9UQP3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TNNQ9UQP3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TNNQ9UQP3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TNNQ9UQP3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TNNQ9UQP3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
TNNQ9UQP3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TNNQ9UQP3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TNNQ9UQP3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TNNQ9UQP3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
TNNQ9UQP3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TNNQ9UQP3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TNNQ9UQP3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TNNQ9UQP3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TNNQ9UQP3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms