Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNRC6BQ9UPQ9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNRC6BQ9UPQ9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNRC6BQ9UPQ9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNRC6BQ9UPQ9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNRC6BQ9UPQ9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNRC6BQ9UPQ9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNRC6BQ9UPQ9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNRC6BQ9UPQ9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNRC6BQ9UPQ9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNRC6BQ9UPQ9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNRC6BQ9UPQ9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNRC6BQ9UPQ9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNRC6BQ9UPQ9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNRC6BQ9UPQ9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNRC6BQ9UPQ9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNRC6BQ9UPQ9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNRC6BQ9UPQ9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNRC6BQ9UPQ9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNRC6BQ9UPQ9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNRC6BQ9UPQ9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNRC6BQ9UPQ9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNRC6BQ9UPQ9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNRC6BQ9UPQ9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNRC6BQ9UPQ9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNRC6BQ9UPQ9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNRC6BQ9UPQ9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNRC6BQ9UPQ9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNRC6BQ9UPQ9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNRC6BQ9UPQ9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNRC6BQ9UPQ9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TNRC6BQ9UPQ9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNRC6BQ9UPQ9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNRC6BQ9UPQ9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNRC6BQ9UPQ9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNRC6BQ9UPQ9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNRC6BQ9UPQ9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNRC6BQ9UPQ9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNRC6BQ9UPQ9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNRC6BQ9UPQ9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNRC6BQ9UPQ9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TNRC6BQ9UPQ9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNRC6BQ9UPQ9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNRC6BQ9UPQ9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TNRC6BQ9UPQ9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TNRC6BQ9UPQ9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNRC6BQ9UPQ9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNRC6BQ9UPQ9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNRC6BQ9UPQ9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNRC6BQ9UPQ9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNRC6BQ9UPQ9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TNRC6BQ9UPQ9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNRC6BQ9UPQ9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNRC6BQ9UPQ9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNRC6BQ9UPQ9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNRC6BQ9UPQ9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNRC6BQ9UPQ9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNRC6BQ9UPQ9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNRC6BQ9UPQ9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNRC6BQ9UPQ9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNRC6BQ9UPQ9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNRC6BQ9UPQ9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNRC6BQ9UPQ9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNRC6BQ9UPQ9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNRC6BQ9UPQ9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNRC6BQ9UPQ9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNRC6BQ9UPQ9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNRC6BQ9UPQ9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNRC6BQ9UPQ9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNRC6BQ9UPQ9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNRC6BQ9UPQ9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNRC6BQ9UPQ9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNRC6BQ9UPQ9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TNRC6BQ9UPQ9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNRC6BQ9UPQ9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNRC6BQ9UPQ9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNRC6BQ9UPQ9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNRC6BQ9UPQ9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNRC6BQ9UPQ9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNRC6BQ9UPQ9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNRC6BQ9UPQ9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TNRC6BQ9UPQ9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TNRC6BQ9UPQ9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNRC6BQ9UPQ9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNRC6BQ9UPQ9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNRC6BQ9UPQ9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNRC6BQ9UPQ9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNRC6BQ9UPQ9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TNRC6BQ9UPQ9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TNRC6BQ9UPQ9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNRC6BQ9UPQ9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNRC6BQ9UPQ9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNRC6BQ9UPQ9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNRC6BQ9UPQ9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNRC6BQ9UPQ9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNRC6BQ9UPQ9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNRC6BQ9UPQ9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms