Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
L1RE1Q9UN81 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
L1RE1Q9UN81 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
L1RE1Q9UN81 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
L1RE1Q9UN81 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
L1RE1Q9UN81 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
L1RE1Q9UN81 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
L1RE1Q9UN81 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
L1RE1Q9UN81 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
L1RE1Q9UN81 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
L1RE1Q9UN81 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
L1RE1Q9UN81 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
L1RE1Q9UN81 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
L1RE1Q9UN81 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
L1RE1Q9UN81 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
L1RE1Q9UN81 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
L1RE1Q9UN81 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
L1RE1Q9UN81 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
L1RE1Q9UN81 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
L1RE1Q9UN81 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
L1RE1Q9UN81 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
L1RE1Q9UN81 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
L1RE1Q9UN81 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
L1RE1Q9UN81 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
L1RE1Q9UN81 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
L1RE1Q9UN81 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
L1RE1Q9UN81 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
L1RE1Q9UN81 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
L1RE1Q9UN81 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
L1RE1Q9UN81 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
L1RE1Q9UN81 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
L1RE1Q9UN81 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
L1RE1Q9UN81 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
L1RE1Q9UN81 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
L1RE1Q9UN81 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
L1RE1Q9UN81 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
L1RE1Q9UN81 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
L1RE1Q9UN81 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
L1RE1Q9UN81 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
L1RE1Q9UN81 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
L1RE1Q9UN81 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
L1RE1Q9UN81 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
L1RE1Q9UN81 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
L1RE1Q9UN81 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
L1RE1Q9UN81 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
L1RE1Q9UN81 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
L1RE1Q9UN81 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
L1RE1Q9UN81 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
L1RE1Q9UN81 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
L1RE1Q9UN81 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
L1RE1Q9UN81 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
L1RE1Q9UN81 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
L1RE1Q9UN81 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
L1RE1Q9UN81 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
L1RE1Q9UN81 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
L1RE1Q9UN81 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
L1RE1Q9UN81 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
L1RE1Q9UN81 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
L1RE1Q9UN81 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
L1RE1Q9UN81 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
L1RE1Q9UN81 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
L1RE1Q9UN81 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
L1RE1Q9UN81 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
L1RE1Q9UN81 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
L1RE1Q9UN81 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
L1RE1Q9UN81 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
L1RE1Q9UN81 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
L1RE1Q9UN81 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
L1RE1Q9UN81 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
L1RE1Q9UN81 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
L1RE1Q9UN81 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
L1RE1Q9UN81 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
L1RE1Q9UN81 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
L1RE1Q9UN81 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
L1RE1Q9UN81 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
L1RE1Q9UN81 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
L1RE1Q9UN81 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
L1RE1Q9UN81 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
L1RE1Q9UN81 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
L1RE1Q9UN81 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
L1RE1Q9UN81 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
L1RE1Q9UN81 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
L1RE1Q9UN81 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
L1RE1Q9UN81 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
L1RE1Q9UN81 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
L1RE1Q9UN81 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
L1RE1Q9UN81 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
L1RE1Q9UN81 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
L1RE1Q9UN81 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
L1RE1Q9UN81 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
L1RE1Q9UN81 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
L1RE1Q9UN81 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
L1RE1Q9UN81 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
L1RE1Q9UN81 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
L1RE1Q9UN81 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
L1RE1Q9UN81 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
L1RE1Q9UN81 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
L1RE1Q9UN81 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
L1RE1Q9UN81 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
L1RE1Q9UN81 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms