Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PCDHA12Q9UN75 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PCDHA12Q9UN75 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PCDHA12Q9UN75 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PCDHA12Q9UN75 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PCDHA12Q9UN75 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PCDHA12Q9UN75 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PCDHA12Q9UN75 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PCDHA12Q9UN75 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PCDHA12Q9UN75 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PCDHA12Q9UN75 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PCDHA12Q9UN75 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PCDHA12Q9UN75 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PCDHA12Q9UN75 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PCDHA12Q9UN75 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PCDHA12Q9UN75 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PCDHA12Q9UN75 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PCDHA12Q9UN75 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PCDHA12Q9UN75 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PCDHA12Q9UN75 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PCDHA12Q9UN75 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PCDHA12Q9UN75 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PCDHA12Q9UN75 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PCDHA12Q9UN75 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PCDHA12Q9UN75 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PCDHA12Q9UN75 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PCDHA12Q9UN75 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PCDHA12Q9UN75 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCDHA12Q9UN75 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCDHA12Q9UN75 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCDHA12Q9UN75 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCDHA12Q9UN75 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCDHA12Q9UN75 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCDHA12Q9UN75 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCDHA12Q9UN75 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCDHA12Q9UN75 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCDHA12Q9UN75 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PCDHA12Q9UN75 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCDHA12Q9UN75 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCDHA12Q9UN75 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCDHA12Q9UN75 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCDHA12Q9UN75 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCDHA12Q9UN75 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCDHA12Q9UN75 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCDHA12Q9UN75 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCDHA12Q9UN75 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCDHA12Q9UN75 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCDHA12Q9UN75 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PCDHA12Q9UN75 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCDHA12Q9UN75 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCDHA12Q9UN75 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCDHA12Q9UN75 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCDHA12Q9UN75 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PCDHA12Q9UN75 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCDHA12Q9UN75 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCDHA12Q9UN75 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCDHA12Q9UN75 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCDHA12Q9UN75 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCDHA12Q9UN75 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCDHA12Q9UN75 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCDHA12Q9UN75 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCDHA12Q9UN75 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCDHA12Q9UN75 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCDHA12Q9UN75 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PCDHA12Q9UN75 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCDHA12Q9UN75 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCDHA12Q9UN75 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCDHA12Q9UN75 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PCDHA12Q9UN75 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PCDHA12Q9UN75 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCDHA12Q9UN75 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCDHA12Q9UN75 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCDHA12Q9UN75 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCDHA12Q9UN75 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCDHA12Q9UN75 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PCDHA12Q9UN75 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCDHA12Q9UN75 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCDHA12Q9UN75 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PCDHA12Q9UN75 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCDHA12Q9UN75 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCDHA12Q9UN75 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCDHA12Q9UN75 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCDHA12Q9UN75 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCDHA12Q9UN75 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCDHA12Q9UN75 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHA12Q9UN75 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHA12Q9UN75 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHA12Q9UN75 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHA12Q9UN75 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHA12Q9UN75 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHA12Q9UN75 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHA12Q9UN75 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCDHA12Q9UN75 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCDHA12Q9UN75 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCDHA12Q9UN75 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCDHA12Q9UN75 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCDHA12Q9UN75 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDHA12Q9UN75 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDHA12Q9UN75 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDHA12Q9UN75 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms