Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PALD1Q9ULE6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PALD1Q9ULE6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
PALD1Q9ULE6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PALD1Q9ULE6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PALD1Q9ULE6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PALD1Q9ULE6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PALD1Q9ULE6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PALD1Q9ULE6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PALD1Q9ULE6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PALD1Q9ULE6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PALD1Q9ULE6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PALD1Q9ULE6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PALD1Q9ULE6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PALD1Q9ULE6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PALD1Q9ULE6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PALD1Q9ULE6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PALD1Q9ULE6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PALD1Q9ULE6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PALD1Q9ULE6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PALD1Q9ULE6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PALD1Q9ULE6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PALD1Q9ULE6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PALD1Q9ULE6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PALD1Q9ULE6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PALD1Q9ULE6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PALD1Q9ULE6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PALD1Q9ULE6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PALD1Q9ULE6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PALD1Q9ULE6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PALD1Q9ULE6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PALD1Q9ULE6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PALD1Q9ULE6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PALD1Q9ULE6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PALD1Q9ULE6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PALD1Q9ULE6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PALD1Q9ULE6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PALD1Q9ULE6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PALD1Q9ULE6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PALD1Q9ULE6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PALD1Q9ULE6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PALD1Q9ULE6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PALD1Q9ULE6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PALD1Q9ULE6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PALD1Q9ULE6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PALD1Q9ULE6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PALD1Q9ULE6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PALD1Q9ULE6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PALD1Q9ULE6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
PALD1Q9ULE6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PALD1Q9ULE6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PALD1Q9ULE6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PALD1Q9ULE6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
PALD1Q9ULE6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PALD1Q9ULE6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PALD1Q9ULE6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PALD1Q9ULE6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PALD1Q9ULE6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PALD1Q9ULE6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PALD1Q9ULE6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PALD1Q9ULE6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PALD1Q9ULE6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PALD1Q9ULE6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PALD1Q9ULE6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PALD1Q9ULE6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PALD1Q9ULE6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PALD1Q9ULE6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PALD1Q9ULE6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PALD1Q9ULE6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PALD1Q9ULE6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PALD1Q9ULE6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PALD1Q9ULE6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PALD1Q9ULE6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PALD1Q9ULE6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PALD1Q9ULE6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PALD1Q9ULE6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PALD1Q9ULE6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PALD1Q9ULE6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
PALD1Q9ULE6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PALD1Q9ULE6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PALD1Q9ULE6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PALD1Q9ULE6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PALD1Q9ULE6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PALD1Q9ULE6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PALD1Q9ULE6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PALD1Q9ULE6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PALD1Q9ULE6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PALD1Q9ULE6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PALD1Q9ULE6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PALD1Q9ULE6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PALD1Q9ULE6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PALD1Q9ULE6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PALD1Q9ULE6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PALD1Q9ULE6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PALD1Q9ULE6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PALD1Q9ULE6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PALD1Q9ULE6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PALD1Q9ULE6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PALD1Q9ULE6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PALD1Q9ULE6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms