Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI7

SLC23A1, Solute carrier family 23 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A1Q9UHI7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC23A1Q9UHI7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC23A1Q9UHI7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC23A1Q9UHI7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC23A1Q9UHI7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC23A1Q9UHI7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC23A1Q9UHI7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC23A1Q9UHI7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC23A1Q9UHI7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC23A1Q9UHI7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC23A1Q9UHI7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC23A1Q9UHI7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC23A1Q9UHI7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC23A1Q9UHI7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC23A1Q9UHI7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC23A1Q9UHI7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC23A1Q9UHI7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC23A1Q9UHI7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC23A1Q9UHI7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC23A1Q9UHI7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC23A1Q9UHI7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC23A1Q9UHI7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC23A1Q9UHI7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC23A1Q9UHI7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC23A1Q9UHI7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC23A1Q9UHI7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC23A1Q9UHI7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC23A1Q9UHI7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC23A1Q9UHI7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC23A1Q9UHI7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC23A1Q9UHI7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC23A1Q9UHI7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC23A1Q9UHI7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC23A1Q9UHI7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC23A1Q9UHI7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC23A1Q9UHI7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC23A1Q9UHI7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC23A1Q9UHI7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC23A1Q9UHI7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC23A1Q9UHI7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC23A1Q9UHI7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC23A1Q9UHI7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC23A1Q9UHI7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC23A1Q9UHI7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC23A1Q9UHI7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC23A1Q9UHI7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC23A1Q9UHI7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC23A1Q9UHI7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC23A1Q9UHI7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC23A1Q9UHI7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC23A1Q9UHI7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC23A1Q9UHI7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC23A1Q9UHI7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC23A1Q9UHI7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC23A1Q9UHI7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC23A1Q9UHI7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC23A1Q9UHI7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC23A1Q9UHI7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC23A1Q9UHI7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC23A1Q9UHI7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC23A1Q9UHI7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC23A1Q9UHI7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC23A1Q9UHI7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC23A1Q9UHI7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC23A1Q9UHI7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC23A1Q9UHI7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC23A1Q9UHI7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC23A1Q9UHI7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC23A1Q9UHI7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC23A1Q9UHI7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC23A1Q9UHI7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC23A1Q9UHI7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC23A1Q9UHI7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC23A1Q9UHI7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC23A1Q9UHI7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC23A1Q9UHI7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC23A1Q9UHI7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC23A1Q9UHI7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC23A1Q9UHI7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC23A1Q9UHI7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC23A1Q9UHI7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC23A1Q9UHI7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC23A1Q9UHI7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC23A1Q9UHI7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC23A1Q9UHI7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC23A1Q9UHI7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC23A1Q9UHI7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC23A1Q9UHI7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC23A1Q9UHI7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC23A1Q9UHI7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC23A1Q9UHI7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC23A1Q9UHI7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC23A1Q9UHI7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC23A1Q9UHI7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC23A1Q9UHI7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC23A1Q9UHI7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC23A1Q9UHI7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC23A1Q9UHI7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC23A1Q9UHI7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC23A1Q9UHI7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms