Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUX4Q9UBX2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUX4Q9UBX2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUX4Q9UBX2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUX4Q9UBX2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUX4Q9UBX2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUX4Q9UBX2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUX4Q9UBX2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUX4Q9UBX2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUX4Q9UBX2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUX4Q9UBX2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUX4Q9UBX2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DUX4Q9UBX2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUX4Q9UBX2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUX4Q9UBX2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUX4Q9UBX2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUX4Q9UBX2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUX4Q9UBX2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUX4Q9UBX2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUX4Q9UBX2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUX4Q9UBX2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUX4Q9UBX2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUX4Q9UBX2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DUX4Q9UBX2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUX4Q9UBX2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUX4Q9UBX2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUX4Q9UBX2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUX4Q9UBX2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUX4Q9UBX2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUX4Q9UBX2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUX4Q9UBX2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUX4Q9UBX2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUX4Q9UBX2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms