Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSFQ9UBX1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSFQ9UBX1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSFQ9UBX1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSFQ9UBX1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSFQ9UBX1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSFQ9UBX1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSFQ9UBX1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSFQ9UBX1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSFQ9UBX1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSFQ9UBX1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSFQ9UBX1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSFQ9UBX1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSFQ9UBX1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSFQ9UBX1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSFQ9UBX1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSFQ9UBX1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSFQ9UBX1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSFQ9UBX1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSFQ9UBX1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSFQ9UBX1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSFQ9UBX1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSFQ9UBX1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSFQ9UBX1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSFQ9UBX1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSFQ9UBX1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSFQ9UBX1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSFQ9UBX1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSFQ9UBX1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSFQ9UBX1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSFQ9UBX1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSFQ9UBX1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSFQ9UBX1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSFQ9UBX1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSFQ9UBX1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTSFQ9UBX1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTSFQ9UBX1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTSFQ9UBX1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSFQ9UBX1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSFQ9UBX1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSFQ9UBX1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSFQ9UBX1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSFQ9UBX1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSFQ9UBX1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSFQ9UBX1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSFQ9UBX1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSFQ9UBX1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSFQ9UBX1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSFQ9UBX1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSFQ9UBX1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSFQ9UBX1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSFQ9UBX1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTSFQ9UBX1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTSFQ9UBX1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTSFQ9UBX1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSFQ9UBX1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSFQ9UBX1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSFQ9UBX1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSFQ9UBX1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSFQ9UBX1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSFQ9UBX1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSFQ9UBX1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSFQ9UBX1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSFQ9UBX1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSFQ9UBX1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSFQ9UBX1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSFQ9UBX1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSFQ9UBX1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms