Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKIRAS2Q9NYR9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKIRAS2Q9NYR9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKIRAS2Q9NYR9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NKIRAS2Q9NYR9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKIRAS2Q9NYR9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKIRAS2Q9NYR9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKIRAS2Q9NYR9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKIRAS2Q9NYR9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKIRAS2Q9NYR9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKIRAS2Q9NYR9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKIRAS2Q9NYR9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKIRAS2Q9NYR9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 993.7 ms