Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWZ3

IRAK4, Interleukin-1 receptor-associated kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRAK4Q9NWZ3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRAK4Q9NWZ3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IRAK4Q9NWZ3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRAK4Q9NWZ3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRAK4Q9NWZ3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IRAK4Q9NWZ3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRAK4Q9NWZ3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRAK4Q9NWZ3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRAK4Q9NWZ3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRAK4Q9NWZ3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRAK4Q9NWZ3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRAK4Q9NWZ3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRAK4Q9NWZ3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRAK4Q9NWZ3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRAK4Q9NWZ3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRAK4Q9NWZ3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRAK4Q9NWZ3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRAK4Q9NWZ3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRAK4Q9NWZ3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRAK4Q9NWZ3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRAK4Q9NWZ3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRAK4Q9NWZ3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRAK4Q9NWZ3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRAK4Q9NWZ3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
IRAK4Q9NWZ3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRAK4Q9NWZ3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRAK4Q9NWZ3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRAK4Q9NWZ3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRAK4Q9NWZ3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRAK4Q9NWZ3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRAK4Q9NWZ3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRAK4Q9NWZ3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRAK4Q9NWZ3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRAK4Q9NWZ3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRAK4Q9NWZ3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRAK4Q9NWZ3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRAK4Q9NWZ3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRAK4Q9NWZ3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRAK4Q9NWZ3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
IRAK4Q9NWZ3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRAK4Q9NWZ3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRAK4Q9NWZ3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRAK4Q9NWZ3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRAK4Q9NWZ3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRAK4Q9NWZ3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRAK4Q9NWZ3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRAK4Q9NWZ3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
IRAK4Q9NWZ3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRAK4Q9NWZ3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRAK4Q9NWZ3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRAK4Q9NWZ3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRAK4Q9NWZ3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRAK4Q9NWZ3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRAK4Q9NWZ3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRAK4Q9NWZ3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRAK4Q9NWZ3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRAK4Q9NWZ3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IRAK4Q9NWZ3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
IRAK4Q9NWZ3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRAK4Q9NWZ3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRAK4Q9NWZ3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRAK4Q9NWZ3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRAK4Q9NWZ3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRAK4Q9NWZ3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRAK4Q9NWZ3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRAK4Q9NWZ3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRAK4Q9NWZ3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRAK4Q9NWZ3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRAK4Q9NWZ3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRAK4Q9NWZ3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRAK4Q9NWZ3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRAK4Q9NWZ3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRAK4Q9NWZ3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRAK4Q9NWZ3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRAK4Q9NWZ3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRAK4Q9NWZ3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRAK4Q9NWZ3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IRAK4Q9NWZ3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRAK4Q9NWZ3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRAK4Q9NWZ3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRAK4Q9NWZ3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRAK4Q9NWZ3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRAK4Q9NWZ3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRAK4Q9NWZ3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRAK4Q9NWZ3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IRAK4Q9NWZ3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRAK4Q9NWZ3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRAK4Q9NWZ3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRAK4Q9NWZ3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRAK4Q9NWZ3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRAK4Q9NWZ3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRAK4Q9NWZ3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRAK4Q9NWZ3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
IRAK4Q9NWZ3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRAK4Q9NWZ3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
IRAK4Q9NWZ3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRAK4Q9NWZ3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRAK4Q9NWZ3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRAK4Q9NWZ3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRAK4Q9NWZ3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms