Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.95
PDS5BQ9NTI5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.95
PDS5BQ9NTI5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC45.92■■■■■ 4.94
PDS5BQ9NTI5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC45.92■■■■■ 4.94
PDS5BQ9NTI5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC45.92■■■■■ 4.94
PDS5BQ9NTI5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC45.91■■■■■ 4.94
PDS5BQ9NTI5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
PDS5BQ9NTI5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC45.88■■■■■ 4.94
PDS5BQ9NTI5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC45.88■■■■■ 4.94
PDS5BQ9NTI5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC45.88■■■■■ 4.94
PDS5BQ9NTI5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.93
PDS5BQ9NTI5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
PDS5BQ9NTI5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC45.86■■■■■ 4.93
PDS5BQ9NTI5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
PDS5BQ9NTI5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
PDS5BQ9NTI5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC45.84■■■■■ 4.93
PDS5BQ9NTI5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
PDS5BQ9NTI5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
PDS5BQ9NTI5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.83■■■■■ 4.93
PDS5BQ9NTI5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC45.82■■■■■ 4.93
PDS5BQ9NTI5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
PDS5BQ9NTI5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
PDS5BQ9NTI5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC45.79■■■■■ 4.92
PDS5BQ9NTI5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
PDS5BQ9NTI5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
PDS5BQ9NTI5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC45.77■■■■■ 4.92
PDS5BQ9NTI5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
PDS5BQ9NTI5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
PDS5BQ9NTI5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC45.76■■■■■ 4.92
PDS5BQ9NTI5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC45.76■■■■■ 4.92
PDS5BQ9NTI5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
PDS5BQ9NTI5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC45.75■■■■■ 4.91
PDS5BQ9NTI5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC45.74■■■■■ 4.91
PDS5BQ9NTI5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC45.74■■■■■ 4.91
PDS5BQ9NTI5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC45.72■■■■■ 4.91
PDS5BQ9NTI5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.71■■■■■ 4.91
PDS5BQ9NTI5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC45.71■■■■■ 4.91
PDS5BQ9NTI5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
PDS5BQ9NTI5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
PDS5BQ9NTI5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC45.66■■■■■ 4.9
PDS5BQ9NTI5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
PDS5BQ9NTI5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC45.64■■■■■ 4.9
PDS5BQ9NTI5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
PDS5BQ9NTI5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
PDS5BQ9NTI5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC45.62■■■■■ 4.89
PDS5BQ9NTI5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC45.62■■■■■ 4.89
PDS5BQ9NTI5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
PDS5BQ9NTI5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC45.6■■■■■ 4.89
PDS5BQ9NTI5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.6■■■■■ 4.89
PDS5BQ9NTI5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
PDS5BQ9NTI5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC45.6■■■■■ 4.89
PDS5BQ9NTI5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
PDS5BQ9NTI5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC45.58■■■■■ 4.89
PDS5BQ9NTI5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC45.58■■■■■ 4.89
PDS5BQ9NTI5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
PDS5BQ9NTI5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC45.57■■■■■ 4.89
PDS5BQ9NTI5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC45.57■■■■■ 4.88
PDS5BQ9NTI5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC45.56■■■■■ 4.88
PDS5BQ9NTI5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC45.56■■■■■ 4.88
PDS5BQ9NTI5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC45.54■■■■■ 4.88
PDS5BQ9NTI5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
PDS5BQ9NTI5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.54■■■■■ 4.88
PDS5BQ9NTI5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
PDS5BQ9NTI5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
PDS5BQ9NTI5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC45.5■■■■■ 4.87
PDS5BQ9NTI5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.5■■■■■ 4.87
PDS5BQ9NTI5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC45.49■■■■■ 4.87
PDS5BQ9NTI5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
PDS5BQ9NTI5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
PDS5BQ9NTI5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.45■■■■■ 4.87
PDS5BQ9NTI5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.87
PDS5BQ9NTI5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.44■■■■■ 4.87
PDS5BQ9NTI5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
PDS5BQ9NTI5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC45.43■■■■■ 4.86
PDS5BQ9NTI5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC45.43■■■■■ 4.86
PDS5BQ9NTI5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
PDS5BQ9NTI5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC45.41■■■■■ 4.86
PDS5BQ9NTI5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
PDS5BQ9NTI5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC45.41■■■■■ 4.86
PDS5BQ9NTI5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
PDS5BQ9NTI5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
PDS5BQ9NTI5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC45.38■■■■■ 4.86
PDS5BQ9NTI5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.38■■■■■ 4.85
PDS5BQ9NTI5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
PDS5BQ9NTI5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
PDS5BQ9NTI5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC45.36■■■■■ 4.85
PDS5BQ9NTI5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
PDS5BQ9NTI5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC45.35■■■■■ 4.85
PDS5BQ9NTI5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC45.34■■■■■ 4.85
PDS5BQ9NTI5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.34■■■■■ 4.85
PDS5BQ9NTI5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
PDS5BQ9NTI5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC45.33■■■■■ 4.85
PDS5BQ9NTI5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
PDS5BQ9NTI5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC45.33■■■■■ 4.85
PDS5BQ9NTI5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
PDS5BQ9NTI5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
PDS5BQ9NTI5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC45.3■■■■■ 4.84
PDS5BQ9NTI5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC45.29■■■■■ 4.84
PDS5BQ9NTI5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC45.28■■■■■ 4.84
PDS5BQ9NTI5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms